生物信息學軟件支持使用質粒作為分子生物學技術。這些程序記錄了質粒載體的 DNA 串聯，有助於預測限制酶的切割位點，併計劃操作。處理質粒圖的軟件包的示例包括ApE，克隆管理器，GeneConstructionKit，Geneious，Genome編譯器，LabGenius，Lasergene，MacVector，pDraw32，串行克隆器，VectorFriends，Vector NTI和WebDSV。這些軟件可幫助您在進行濕式實驗之前，通過計算機進行整個實驗。
質粒收集
這些年來已經創建了許多質粒，研究人員已經將質粒提供給質粒數據庫，例如非營利組織Addgene和BCCM / LMBP。人們可以從這些數據庫中鑑定和徵集質粒用於研究。此外，研究人員經常將質粒序列上傳至 NCBI 數據庫，從中可以檢索特定質粒的序列。
質粒組
環境的質粒組是指存在於其中的質粒，該術語是兩個英文單詞``質粒''和``王國''的portmanteau。微生物並研究其擁有的質粒，或者通過採集環境樣本並使用下一代測序方法進行宏基因組學調查來進行調控，以鑑定和表徵屬於該環境的質粒基因組。
圖片239A | pBR322 載體的示意圖，其限制性位點用藍色表示。| Ayacop （+ Yikrazuul）/ Public domain | Page URL ：（https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg） from Wikimedia Commons
مؤلف : Milos Pawlowski
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