核醣體基因間隔區分析

核醣體 RNA （rRNA）基因間隔檢查（RISA）是微生物群落檢查的一種作用，它提供了一種比較不同環境或治療影響的方法，而沒有依賴於培養物的方法造成的偏見。這種檢查通常稱為社區指紋識別。 RISA涉及 PCR 擴增小（16S）和大（23S）亞基之間的rRNA基因操縱子區域，稱為基因間隔區ISR。

通過使用針對16S和23S基因保守區的寡核苷酸引物，可以從環境樣品中的大多數優勢細菌中產生RISA片段。另一方面，大多數rRNA操縱子可提供結構服務，部分16S-23S基因間區域可根據細菌種類編碼tRNA。然而，ISR的分類學價值在於長度和核苷酸串聯的顯著異質性。在RISA中，我們嘗試利用ISR的長度異質性，該異質性已顯示在150到1500 bp之間，而大多數ISR長度在150到500 bp之間。

圖片250A | 利用來自測試儀樣本的cDNA和SSH庫進行的一般反向 northern blot 程序。測試儀樣品中轉錄本的過表達將在膜上以暗點出現。Cddouglas2 / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL ：（https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Revnorthern1.jpg） from Wikimedia Commons

作者 : Yavor Mendel

參考文獻：

分子生物學技術II

分子生物學工具VI