最初提出將Strand-seq作為公開姐妹染色單體交換的工具。作為一種局限於單個細胞的作用， DNA 測序一個以上的細胞將絕對分散這些作用，並提示不存在SCE事件。另外，由於異質擴增偏差和雙鏈串聯信息，經典的單細胞測序技術無法顯示這些事件，因此需要鏈序列。使用參考比對信息，研究人員可以在遺傳模板鏈的方向改變時公開SCE。
識別方向錯誤的重疊群
方向錯誤的重疊群在參考基因組中的出現率很高（例如，在小鼠參考基因組中為1％）。與傳統測序方法相比，Strand-seq可以發現這些錯誤方向。存在方向錯誤的重疊群，其中鏈遺傳從一種純合狀態變為另一種純合狀態（例如WW到CC，或CC到WW）。此外，此狀態更改在每個Strand-seq庫中都是可見的，從而增強了錯誤取向重疊群的存在。
圖片263A | BAIT的輸出，顯示Watson（W，綠色）和Crick（C，藍色）鏈的讀取計數。每個讀取的枚舉條顯示與參考基因組的特定200 kb bin對齊的分析次數。從這裡，可以推斷出父母模板鏈的遺傳。例如，如果子細胞中200-kb染色體片段的兩個拷貝都是從親本細胞中的Watson模板鏈合成的，這將由一個大的綠色條表示，表示該染色體區域中的純W排列。同樣，模板鏈遺傳的純合和雜合狀態之間的轉換也被解釋為姐妹染色單體交換（SCE）。 | Maia.smith / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL ：（https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Bioinformatic_Analysis_of_Inherited_Templates_ from Wikimedia Commons （BAIT） from Wikimedia Commons _Output.png） from Wikimedia Commons
مؤلف : Yavor Mendel
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