單細胞微球菌核酸酶測序(scMNase-seq)是一種新穎的技術,可用於僅通過單細胞輸入來分析核小體定位並推斷染色質可及性。首先,使用熒光激活的細胞分選法將細胞分為單個等分試樣( FACS )。然後將細胞裂解並用微球菌核酸酶消化。將分離的 DNA 進行 PCR 擴增,然後分離並分析所需的串聯。在單細胞測定中使用 MNase 會增加區域(例如 DNase I超敏位點)作為複制因子結合位點的檢測。
與另一種染色質可及性分析的比較
MNase-seq 是四種主要方法(DNase-seq, MNase-seq ,FAIRE-seq和ATAC-seq)中的一種,可以更直接地確定染色質的可及性和隨後對基因表達形式的影響。所有這四種技術均與 ChIP-seq 形成對比, ChIP-seq 依靠這樣的推論,即 histone 尾部上的某些標記指示基因激活或抑制,而不是直接評估核小體的定位,而是對 histone 修飾子的評估有價值酶促服務。
圖片218A | MNase 在測序中的技術應用| Omerriya / CC BY-SA(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode)| Page URL :(https://commons.wikimedia.org/wiki/File:MNASE_application.png) from Wikimedia Commons
مؤلف : Milos Pawlowski
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